Nel Museo, diviso per sezioni, sono presenti i materiali dei villaggi neolitici della foce del Candelabro. Molto interessante è l'esposizione delle stele daunie: lastre calcaree di forma rettangolare, completate da teste iconiche ( con i particolari del volto) e aniconiche (con la sola notazione di un copricapo). Una sezione è dedicata alla Daunia antica e il mare con dati sull'archeologia sunacquea lungo il litorale.