L'esposizione del Museo è divisa in diverse sezioni, in quella biologica espone esemplari di fauna provenienti da grotte di tutto il mondo come i pesci ciechi dei pozzi della Somalia, insetti e crostacei della grotta di Zinzulusa e altri esemplari. La sezione geologica raccoglie numerosi minerali e Campioni di rocce provenienti da giacimenti di tutto il mondo. La collezione di fossili esposta nella sezione di paleontologia generale contiene numerosi reperti disposti in ordine cronologico. Nelle teche della sezione paleontologica umana è narrata l'evoluzione dell'uomo.
Nel Museo è inoltre attivo un laboratorio di restauro.