Die Kirche und der Konvent San Francesco sind der größte und bedeutendste Monumentalkomplex der gesamten Altstadt. Generell wird die Errichtung auf die Zeit der Durchreise des Heiligen Franziskus durch Tarent zurückgeführt. Dieses Ereignis, von dem keinerlei sichere Überlieferungen vorliegen, erklärt die wichtige Rolle der Franziskaner in der Stadt, die diesen Ort wählten, um ihre erste Gemeinde anzusiedeln. Mit großer Wahrscheinlichkeit wurde der Komplex im 14. Jahrhundert errichtet und setzte sich ursprünglich aus dem Konvent sowie einer kleinen Kirche zusammen. Der Mitte des 17. Jahrhunderts restaurierte Konvent wurde im Verlauf der Jahrhunderte für verschiedenste Zwecke genutzt. Im 18. Jahrhundert war er Sitz der Gemeindeverwaltung, später wurde er Quartier der napoleonischen Truppen unter dem Namen Rossarol-Kaserne. Von besonders kunstvoller Ausführung ist der Kreuzgang mit vier Laubengängen, deren kostbare Kreuzgewölbe auf beeindruckenden Pilastern ruhen.